單獨合成 單獨質控
捕獲表現
圖 2. NEXome Core Panel 對不同 gDNA 文庫的捕獲表現。
A. 捕獲數據比對率和捕獲效率; B. 靶區域覆蓋度;C. 覆蓋均一性和一致性;D. GC 偏好性。300 ng gDNA 利用 NadPrep? 文庫構建系列試劑盒建庫,以 NEXome Core Panel (6 plex) 完成雜交捕獲。利用 BWA 比對到參考基因組 hg38,按照 reads 數計算。測序平臺:Illumina Novaseq 6000,PE150;DNBSEQ-T7,PE150。
注:Male:人類男性基因組 DNA (Promega-Male, G1471);Female:人類女性基因組 DNA (Promega-Female, G1521)。
圖 3. NEXome Core Panel 捕獲數據中變異頻率與標準品頻率的一致性。
利用 NadPrep? 文庫構建系列試劑盒建庫,以 NEXome Core Panel 完成雜交捕獲,Vardict 進行變異分析。測序平臺:Illumina Novaseq 6000,PE150;DNBSEQ-T7,PE150。
注:樣本為泛腫瘤 800 gDNA 標準品 (菁良,GW-OGTM800),投入量 100 ng。
圖 4. 不同外顯子組 Panel 對不同 gDNA 文庫的捕獲效率和靶區域覆蓋均一性的比較。
A. 捕獲中靶率;B. 靶區域覆蓋均一性;C. 靶區域覆蓋深度。利用 BWA 比對到參考基因組 hg38,按照 reads 數計算。測序平臺:Illumina Novaseq 6000,PE150。
圖 5. 相同測序數據量下不同全外顯子組 Panel 在 80% 靶區域可達到的覆蓋深度。
圖 6. NEXome Core Panel 實際覆蓋情況示例。
貨號 |
管蓋
顏色 |
產品名稱 |
包裝
體積 |
包裝/儲存溫度 |
1001852 |
|
NEXome Core Panel, 16 rxn |
70 μL |
–20℃ |
1001851 |
|
NEXome Core Panel, 96 rxn |
415 μL |
–20℃ |
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產品 | 貨號 |
NEXome Core Panel, 96 rxn | 1001851 |
NEXome Core Panel, 16 rxn | 1001852 |
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