NEXome Core Panel
#1001851（96 rxn）
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生產質量與控制
單獨合成 單獨質控
產品性能
捕獲表現
圖 2. NEXome Core Panel 對不同 gDNA 文庫的捕獲表現。
A. 捕獲數據比對率和捕獲效率； B. 靶區域覆蓋度；C. 覆蓋均一性和一致性；D. GC 偏好性。300 ng gDNA 利用 NadPrep? 文庫構建系列試劑盒建庫，以 NEXome Core Panel (6 plex) 完成雜交捕獲。利用 BWA 比對到參考基因組 hg38，按照 reads 數計算。測序平臺：Illumina Novaseq 6000，PE150；DNBSEQ-T7，PE150。
注：Male：人類男性基因組 DNA (Promega-Male, G1471)；Female：人類女性基因組 DNA (Promega-Female, G1521)。
變異一致性分析
圖 3. NEXome Core Panel 捕獲數據中變異頻率與標準品頻率的一致性。
利用 NadPrep? 文庫構建系列試劑盒建庫，以 NEXome Core Panel 完成雜交捕獲，Vardict 進行變異分析。測序平臺：Illumina Novaseq 6000，PE150；DNBSEQ-T7，PE150。
注：樣本為泛腫瘤 800 gDNA 標準品 (菁良，GW-OGTM800)，投入量 100 ng。
競品比較
圖 4. 不同外顯子組 Panel 對不同 gDNA 文庫的捕獲效率和靶區域覆蓋均一性的比較。
A. 捕獲中靶率；B. 靶區域覆蓋均一性；C. 靶區域覆蓋深度。利用 BWA 比對到參考基因組 hg38，按照 reads 數計算。測序平臺：Illumina Novaseq 6000，PE150。
圖 5. 相同測序數據量下不同全外顯子組 Panel 在 80% 靶區域可達到的覆蓋深度。
圖 6. NEXome Core Panel 實際覆蓋情況示例。
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貨號 |
管蓋
顏色 |
產品名稱 |
包裝
體積 |
包裝/儲存溫度 |
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1001852 |
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NEXome Core Panel, 16 rxn |
70 μL |
–20℃ |
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1001851 |
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NEXome Core Panel, 96 rxn |
415 μL |
–20℃ |
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- NEXome 只是減少了不必要的外顯子側翼覆蓋，對于側翼 20 bp 的覆蓋是完全可以保證的。
- 如下圖所示，測序數據共 10 G，insert size 236 bp 的數據中，99.7% 的外顯子側翼 20 bp 處達到 20x 覆蓋，90% 外顯子達到 53x，80% 達到 65x。
| 產品 | 貨號 |
| NEXome Core Panel, 96 rxn | 1001851 |
| NEXome Core Panel, 16 rxn | 1001852 |
產品資料
應用指南
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